东门屿的主峰如同一个巨大的盆景。岩石叠起的山峰，怪石嶙峋，高耸于东山港出洋之要冲，一片坦荡的水，一座突兀的峰，相映成趣。

东门屿整岛呈“工”字型，分为南段、中段、北段三个部分。 东门屿南段由几座小山丘组成，是屿上景观丰富、较集中的地段。以天然的礁石形成的、形态各异的奇石怪洞景观，散布其间，移步换景，满眼皆美；有众多的人文景观，点缀其中，内涵丰富。屿上的绿化率极高，树木青翠，海风吹来，带着淡淡的泥土气息，沁人心脾

玩海之余，可以品尝水果，欣赏花卉，也是一种不错的享受。 东门屿的北段称“佛澳”，沿海滨的四周是礁石和小沙滩，中间有几座小山丘，山上植被绿化，以防风防沙和抗碱树种为主，如木麻黄、相思树等。

明代的东明寺，原来只是一座小庙，近年来海内外信众募集巨资进行扩建，建成了万佛宝殿、天王殿、卧佛坛等庙宇，共计六千多平方米，形成了一个颇具规模的寺庙群。寺的南面有小沙滩、礁石、洞穴，并有众多的石刻碑刻点缀其中。周围自然景色秀美，山林郁郁葱葱，幽静宜人。

东西两个沙滩都是游泳戏浪的好去处。米黄色的沙滩，略显弧形，拱着一湾洁净的海水，恰成一巨大的“X”形。 刮风时，别处是海浪汹涌，而这里只是微波细浪；微风之时，别处是细浪逶迤，而这里的水面却是波平如镜，是良好的天然海滨浴场。中间的防风林带已开辟成林场，引种了大量的果树，如柑桔等；栽培了各种的花卉，如三角梅，夹竹桃等。

登上塔屿海拔91米的主峰，就可以见到文峰塔。塔为八角形密檐式实心建筑，共七层，由花岗岩砌成，是明嘉靖5年（526年）由福建巡海道蔡潮所建。

科幻影片《珊瑚岛上的死光》中的“马太博士岛”就是东门屿。《西游记》《海之恋》《八仙过海》等电影、电视剧，也都是将东门屿作为外景的拍摄基地。东门屿如此吸引电视、电影艺术家的，是她的自然景观，是神韵天成，不需任何雕饰的天然美景。东门屿因此也被称为“天然影棚”。